1. 소스를 직접 보지 않은 이상 정확한 답은 드리기 어렵습니다.
다만, 2차 메뉴가 14개까지만 나온다고 하셨는데, 2차 메뉴의 출력 숫자에 제한을 둔 것이 아니라 레이아웃의 가로 폭 때문에 더 많은 그 폭을 넘어가는 2차 메뉴가 출력이 안 되는 것일 겁니다.
아마 소스에서 한 줄의 범위를 넘어가는 메뉴 부분은 화면에 출력이 안 되게 css로 제한이 걸려있을 가능성이 많은데요.
아마 overflow:hidden 등으로 막아 두었을 가능성이 많습니다.
2차 메뉴 부분의 css를 살펴보시고, 그 부분을 풀어버리신다면 2차 메뉴가 가로폭을 넘을 때 2줄로 출력이 될 듯 합니다.

2. 말씀하신 소스는 현재 XpressEngine의 공식 레이아웃(XE Official Ver2)에 소스가 들어 있을 것 같은데요?
그 방식과 동일한 것으로 보아서요...

XE Official Ver2 레이아웃 다운로드 받으셔서, layout.html파일의 193~219줄

<div id="sitemap">

<div class="extension">

<div class="section logo">

                    <!--@if(!$layout_info->sitemap_image)-->

<img src="img/xeKnee.gif" width="102" height="55" alt="XE&#8482; CLEVER CONTENT MANAGEMENT SYSTEM" />

                    <!--@else-->

<img src="{$layout_info->sitemap_image}" alt="" />

                    <!--@end-->

</div>

                <!--@foreach($main_menu->list as $key => $val)-->

                <!--@if($val['link'])-->

<div class="section">

<h2><a href="{$val['href']}"<!--@if($val['open_window']=='Y')--> onclick="window.open(this.href);return false;"<!--@end-->>{$val['text']}</a></h2>

                    <!--@if($val['list'])-->

<ul>

                        <!--@foreach($val['list'] as $k => $v)-->

                        <!--@if($val['link'])-->

<li><a href="{$v['href']}"<!--@if($v['open_window']=='Y')--> onclick="window.open(this.href);return false;"<!--@end-->>{$v['text']}</a></li>

                        <!--@end-->

                        <!--@end-->

</ul>

                    <!--@end-->

</div>

                <!--@end-->

                <!--@end-->

</div>

</div>

과 관련된 css 항목을 참고 하셔서 만들어 보시면 될 듯 합니다.

항상 감사합니다.^*^